L'Observatoire est un lieu où s'échangent les expériences, s'expriment les compétences, sont associés tous les acteurs de la prévention.

Son organisation comporte en trois niveaux :

•  une instance de décision, l’assemblée plénière des membres nommés par arrêté pour trois ans, avec son président et le rapporteur général. Elle se réunit au moins tous les deux mois pour définir les orientations de travail, auditionner sur le thème de la sécurité et adopter les rapports.

•  une instance exécutive, le comité de pilotage, émanation de l’assemblée plénière. Il se réunit mensuellement afin de préparer et d’orienter les travaux des commissions, proposer l’architecture du rapport annuel, rendre compte des travaux de l’assemblée plénière. Des experts l’assistent de leur compétence technique (préventionnistes, architectes, médecins, spécialistes du contrôle et de l’inspection du travail).

•  des espaces de réflexions thématiques, les commissions, composées de membres de l’assemblée plénière, d’experts et de consultants. Leur composition peut être modifiée en fonction des orientations annuelles de l’Observatoire.
Elles réalisent le travail de fond et rédigent rapports et dossiers qui portent essentiellement sur :
- la sécurité bâtiment et le risque incendie,
- les équipements sportifs,
- les formations professionnelles, technologiques et expérimentales,
- les risques majeurs,
- la santé et l’hygiène,
- l’accessibilité,
- l’accidentalité


La préparation, la logistique et l’animation de l’ensemble des travaux des instances de l’Observatoire sont assurées par un secrétariat général de 4 personnes. Il a en charge les actions d’information et de communication ainsi que les relations avec les différents partenaires.

Les partenaires de l'Observatoire
En dehors des organismes qui en sont membres, l’Observatoire a mis en place un partenariat au niveau national, avec :
- le haut fonctionnaire de Défense et de Sécurité des ministères chargés de l’Éducation et de l’Enseignement supérieur,
- les autorités académiques : recteurs, inspecteurs d’académie,
- les inspecteurs hygiène et sécurité,
- les coordonnateurs sécurité et risques majeurs,
- les ACMO (Agents chargés de la mise en œuvre hygiène et sécurité),
- les DDEN (Délégués départementaux de l’Éducation nationale),
- les SDIS (Services départementaux d’incendie et de secours),
- l’INRS (Institut national de recherche en sécurité),
- le COPREC-Construction (regroupement d’organismes de contrôle)
- le ministère chargé de l’Environnement et du développement durable,
- la Commission de sécurité des consommateurs,
- l’IFFO RME (Institut français des formateurs risques majeurs et protection de l’environnement).

Ces différents partenaires sont associés aux travaux des commissions et groupes de travail spécifiques ainsi qu’aux séminaires organisés par l’Observatoire. Ils y apportent leur expérience de terrain.

Au niveau international, l’Observatoire se trouve étroitement associé aux réseaux européens favorisant l’émergence d’une culture de la sécurité scolaire dépassant les périmètres nationaux.

En partenariat avec le programme d'échange de l'OCDE, la direction générale de l'environnement à la commission européenne ou l'accord EUR-OPA Risques Majeurs au Conseil de l'Europe, il intervient dans des colloques internationaux consacrés à la prévention. Son fonctionnement et ses travaux retiennent l'attention de plusieurs pays au point qu'une recommandation européenne porte depuis 2002 sur la création d'observatoires nationaux de la sécurité des établissements scolaires.